이러한 가운데 1984년 우리나라에 대규모 수해가 발생하자 북한은 남한에게 수해물자를 지원하겠다는 제의를 했고, 우리 정부가 이를 수용함에 따라 버마 폭발사건 이후 냉각된 남북관계는 화해의 분위기가 조성되는 듯 보였다. 하지만, 겉으로는 남북대화에 진전이 있는 듯 보였지만 북한은 체육회담, 적십자회담 등 남한과의 대화에서 일방적인 연기와 통보를 반복해 나갔다. 이 같은 상황에서 통일자문회의는 즉각 성명을 내고 북한은 민족적 양심으로 돌아와 경제회담과 적십자회담은 물론 남북간의 대화와 교류에 조건 없이 응해줄 것을 촉구하였다. 결국 이와 같은 노력으로 성사된 적십자회담은 이산가족 상봉이라는 역사적 성과로 이어지게 되었다.

1986년 10월, 정부는 북한에서 중부권을 삽시간에 물바다로 만들 ‘금강산댐’을 건설한다고 하자 즉각 ‘대북한 성명문’을 발표해 금강산댐의 건설 계획 중단을 북한 측에 강력히 요구했으며, ‘평화의 댐’ 건설 사업을 추진했다. 당시 온 국민의 결연한 의지가 담긴 평화의 댐 건설 성금 모금운동을 통해 6개월 동안 640억 원의 성금이 모였는데, 자문위원들의 적극적인 모금활동이 크게 일조했다.

당시 88올림픽의 공식표어처럼 86아시안게임과 88올림픽은 한국을 국제사회의 당당한 일원으로 급성장시킨 계기를 마련했으며 ‘중국과 일본 근처에 있는 조그만 나라’ 정도로만 알려졌던 한국의 이미지를 대외적으로 향상시켰다.

민주평화통일자문회의는 평화통일을 지향하는 이념적 조직체로서, 또 북한의 어떠한 정치·사상·심리전도 단호히 제압할 수 있는 기구로서, 그리고 국내외 동포의 강렬한 통일의지를 결집하는 구심체로서, 민주발전의 새 시대에 부합하기 위해 노력할 것을 밝혔다. 또한 초당적·범국민적인 참여를 제도화하고 민주적인 운영과 통일에 대한 각계각층의 의견을 광범하게 수렴하고 이를 정책화하여 자문건의 활동을 추진키로 했다.